區域水資源不足地區因可供應地面水源不足，導入高耗水產業確將因供水不穩定而增加抽用地下水引致地層下陷之風險，基此，於經濟開發及產業發展規劃上，實應考量該地區可供應水源條件及地層下陷環境，若欲於該區域引進高耗水產業，必須搭配新增水源規劃。目前本署除積極開發替代水源，如中部之湖山水庫、大度攔河堰、鳥嘴潭攔河堰等，以增供地面水外，亦積極規劃分階段填塞不應存在或對環境負面影響較大之違法水井，以維社會公平正義，減緩地層下陷嚴重程度。另亦嘗試由地下水位觀測資料及地質條件，以掌握地下水利用動態資訊，建立地下水合理利用機制。